Se ha comprobado la existencia de BQ en pacientes que sufren reflujo gastroesofágico, tras la inhalación de gases tóxicos (NH4 o SO2), asociadas a síndrome de Sjögren y hasta en el 30% de los enfermos con artritis reumatoide, a veces incluso antes del desarrollo de la enfermedad reumática y con valor pronóstico. Las BQ son una complicación rara de otras enfermedades autoinmunes o del tejido conectivo, tales como el lupus eritematoso sistémico o el síndrome de Marfan. También se han descrito BQ asociadas a enfermedades inflamatorias intestinales, sobre todo la colitis ulcerosa.